（1）有機物污染：污泥中有機污染物主要有苯、氯酚、多氯聯苯(PCBs)、多氯二苯并呋喃（PCDFs）和多氯二苯并二惡英 (PCDDs)等。污泥中含有的有機污染物不易降解、毒性殘留時間長，這些有毒有害物質進入水體與土壤中將造成環境污染。
（2）病原微生物污染：污水中的病原微生物和寄生蟲卵經過處理會進入污泥，污泥中病原體對人類或動物的污染途徑包括直接與污泥接觸、通過食物鏈與污泥直接接觸、水源被病原體污染、病原體先污染土壤后污染水體等。
（3）重金屬污染：在污水處理過程中，70%～90%的重金屬元素會通過吸附或沉淀而轉移到污泥中。一些重金屬元素主要來源于工業排放的廢水如鎘、鉻等。另外，還有的重金屬來源于家庭生活的管道系統如銅、鋅等。
（4）其它危害：污泥對環境的二次污染還包括污泥鹽份的污染和氮、磷等養分的污染。污泥含鹽量較高會明顯提高土壤電導率，破壞植物養分平衡，抑制植物對養分的吸收，甚至對植物根系造成直接的傷害。在降雨量較大地區且土質疏松土地上大量施用富含氮、磷等的污泥之后，當有機物的分解速度大于植物對氮、磷的吸收速度時，氮、磷等養分就有可能隨水流失而進入地表水體造成水體的富營養化，進入地下引起地下水的污染。
